熒光PCR法,全稱為實時熒光定量聚合酶鏈式反應(Real-Time Fluorescent Quantitative PCR),是一種在DNA擴增過程中實時監測熒光信號變化的技術。
熒光PCR法的基本工作原理:
1.引物設計與特異性結合:實驗人員需設計一對與待測DNA模板序列兩端互補的特定引物,確保其僅與目標序列結合,避免非特異性擴增。
2.熒光標記探針或染料的應用
-TaqMan探針法:探針與目標DNA序列互補配對,且攜帶熒光基團和淬滅基團。在PCR延伸階段,DNA聚合酶的外切酶活性將探針水解,熒光基團與淬滅基團分離,釋放熒光信號。
-SYBR Green I染料法:SYBR Green I是一種結合于所有dsDNA雙螺旋小溝區域的染料,具有綠色激發波長。在游離狀態下,SYBR Green I發出微弱的熒光,但一旦與雙鏈DNA結合后,熒光信號會大大增強。因此,SYBR Green I的熒光信號強度與雙鏈DNA的數量相關,可以根據熒光信號檢測出PCR體系中的雙鏈DNA數量。
3.擴增過程與熒光信號監測:PCR反應遵循變性、退火、延伸的循環規律。每個循環結束后,儀器通過激光激發熒光基團,檢測熒光信號強度,并記錄達到設定閾值時的循環數(Ct值)。Ct值與起始模板拷貝數呈線性關系,通過標準曲線可計算待測樣本的初始DNA量。
4.數據分析與定量:利用已知濃度的標準品建立標準曲線,將待測樣本的Ct值代入曲線方程,即可推算出原始模板的拷貝數。此方法實現了從定性到準確定量的跨越。
熒光PCR法的使用方法:
1.定期校準:確保儀器在使用前經過定期的校準和驗證,以保證數據的準確性。
2.清潔光學系統和樣品倉:定期清潔光學系統和樣品倉,保持設備內部清潔,避免污染影響測量精度。
3.檢查反應板:確保反應板無損壞且孔位正確,以避免影響反應效率。
4.日常維護:每次實驗后,應及時清理儀器表面的污漬和殘留物,并對關鍵部件進行消毒處理。同時,定期對儀器進行檢查和維護,及時發現并解決潛在問題。